在笔法方面,他专主用中锋,在《柴丈人画说》中认为“笔要中锋为第一,惟中锋乃可以学大家,若偏锋则不能见重于当代,况传后乎?”提出中锋用笔要古、健、老、活,方能避免刻、结、板之病。在创作中,他善以苍劲凝练、沉郁浑润的笔墨,勾画出林木山石的形象,方而不板,洁而不滑,正如
程正揆所赞誉的:“铁干银钩老笔翻,力能从简意能繁。”
故宫博物院藏《水墨山水图》即鲜明体现了他这一用笔特点。龚贤的用墨最具特色,他主张墨气要厚、要润。为表现江南山水的滋润景象,他继承和发扬了宋人的积墨法,山石树木多次皴擦渲染,墨色极为浓重,但浓重中又有细微的深浅变化和巧妙的明暗对比。大部分轮廓线与皴染浑为一体,又适当留出高光和坚实的轮廓。山石厚重的体积和坚硬的质感,空气的润湿和阳光的映照感,都巧妙地表现出来。江南山川的茂密、滋润、明媚、深远的特征,被披露得十分鲜明、突出。《清凉环翠图》、《摄山栖霞图》(均藏故宫博物院)都是善用墨色的代表作。所画山水,大都取材于南京一带风光。在如何布置丘壑方面,他提出了“奇”与“安”、“实境”与“幻境”的理论,即描绘自然既要妥贴合理又要不一般化,既要符合现实“实境”又要更美更理想。因此,他画的景色多为江南丰饶明丽的湖光山色,生意盎然,平稳宁静而又引人入胜。《千岩万壑图》(南京博物馆)是他在布局方面的范例。